Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SYNJ2O15056 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SYNJ2O15056 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC33.8■■■■□ 3
SYNJ2O15056 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SYNJ2O15056 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SYNJ2O15056 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SYNJ2O15056 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
SYNJ2O15056 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
SYNJ2O15056 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SYNJ2O15056 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SYNJ2O15056 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SYNJ2O15056 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SYNJ2O15056 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC33.78■■■■□ 3
SYNJ2O15056 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SYNJ2O15056 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
SYNJ2O15056 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SYNJ2O15056 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SYNJ2O15056 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SYNJ2O15056 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SYNJ2O15056 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SYNJ2O15056 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SYNJ2O15056 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SYNJ2O15056 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SYNJ2O15056 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
SYNJ2O15056 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SYNJ2O15056 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SYNJ2O15056 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SYNJ2O15056 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC33.77■■■■□ 3
SYNJ2O15056 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SYNJ2O15056 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SYNJ2O15056 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SYNJ2O15056 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
SYNJ2O15056 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
SYNJ2O15056 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
SYNJ2O15056 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
SYNJ2O15056 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SYNJ2O15056 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
SYNJ2O15056 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC33.76■■■■□ 3
SYNJ2O15056 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
SYNJ2O15056 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms