Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EIF3FO00303 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EIF3FO00303 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EIF3FO00303 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EIF3FO00303 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EIF3FO00303 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EIF3FO00303 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms