Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DFFAO00273 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DFFAO00273 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DFFAO00273 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DFFAO00273 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DFFAO00273 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DFFAO00273 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DFFAO00273 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DFFAO00273 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DFFAO00273 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DFFAO00273 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DFFAO00273 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DFFAO00273 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DFFAO00273 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DFFAO00273 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DFFAO00273 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DFFAO00273 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DFFAO00273 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DFFAO00273 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DFFAO00273 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DFFAO00273 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DFFAO00273 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DFFAO00273 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DFFAO00273 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DFFAO00273 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DFFAO00273 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DFFAO00273 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DFFAO00273 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DFFAO00273 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DFFAO00273 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DFFAO00273 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DFFAO00273 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DFFAO00273 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DFFAO00273 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DFFAO00273 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DFFAO00273 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DFFAO00273 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DFFAO00273 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DFFAO00273 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DFFAO00273 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DFFAO00273 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DFFAO00273 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DFFAO00273 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DFFAO00273 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DFFAO00273 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DFFAO00273 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DFFAO00273 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DFFAO00273 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DFFAO00273 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DFFAO00273 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DFFAO00273 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DFFAO00273 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DFFAO00273 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DFFAO00273 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DFFAO00273 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DFFAO00273 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DFFAO00273 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DFFAO00273 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DFFAO00273 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DFFAO00273 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DFFAO00273 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DFFAO00273 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DFFAO00273 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DFFAO00273 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DFFAO00273 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DFFAO00273 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DFFAO00273 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DFFAO00273 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DFFAO00273 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DFFAO00273 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DFFAO00273 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DFFAO00273 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DFFAO00273 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DFFAO00273 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DFFAO00273 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DFFAO00273 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DFFAO00273 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DFFAO00273 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DFFAO00273 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DFFAO00273 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DFFAO00273 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DFFAO00273 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DFFAO00273 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DFFAO00273 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DFFAO00273 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DFFAO00273 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DFFAO00273 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DFFAO00273 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DFFAO00273 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DFFAO00273 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DFFAO00273 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DFFAO00273 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DFFAO00273 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DFFAO00273 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DFFAO00273 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DFFAO00273 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DFFAO00273 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DFFAO00273 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DFFAO00273 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DFFAO00273 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms