Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms