Protein–RNA interactions for Protein: I3L4J1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L4J1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
I3L4J1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
I3L4J1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
I3L4J1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
I3L4J1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
I3L4J1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
I3L4J1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
I3L4J1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
I3L4J1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
I3L4J1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
I3L4J1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
I3L4J1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
I3L4J1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
I3L4J1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
I3L4J1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
I3L4J1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
I3L4J1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
I3L4J1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
I3L4J1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
I3L4J1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
I3L4J1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
I3L4J1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
I3L4J1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
I3L4J1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
I3L4J1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
I3L4J1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
I3L4J1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
I3L4J1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
I3L4J1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
I3L4J1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
I3L4J1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
I3L4J1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
I3L4J1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
I3L4J1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
I3L4J1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
I3L4J1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
I3L4J1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
I3L4J1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
I3L4J1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
I3L4J1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
I3L4J1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
I3L4J1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
I3L4J1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
I3L4J1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
I3L4J1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
I3L4J1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
I3L4J1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
I3L4J1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
I3L4J1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
I3L4J1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
I3L4J1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
I3L4J1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
I3L4J1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
I3L4J1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
I3L4J1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
I3L4J1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
I3L4J1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
I3L4J1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
I3L4J1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
I3L4J1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
I3L4J1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
I3L4J1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
I3L4J1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
I3L4J1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
I3L4J1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
I3L4J1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
I3L4J1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
I3L4J1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
I3L4J1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
I3L4J1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
I3L4J1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
I3L4J1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
I3L4J1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
I3L4J1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
I3L4J1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
I3L4J1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
I3L4J1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
I3L4J1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
I3L4J1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
I3L4J1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
I3L4J1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
I3L4J1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
I3L4J1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
I3L4J1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
I3L4J1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
I3L4J1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
I3L4J1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
I3L4J1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
I3L4J1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
I3L4J1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
I3L4J1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
I3L4J1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
I3L4J1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
I3L4J1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
I3L4J1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
I3L4J1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
I3L4J1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
I3L4J1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
I3L4J1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
I3L4J1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms