Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP17L12C9JPN9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
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