Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN25C9JDP6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN25C9JDP6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN25C9JDP6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN25C9JDP6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN25C9JDP6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN25C9JDP6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN25C9JDP6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN25C9JDP6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN25C9JDP6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN25C9JDP6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN25C9JDP6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN25C9JDP6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms