Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms