Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms