Protein–RNA interactions for Protein: A8K8P3

SFI1, Protein SFI1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFI1A8K8P3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFI1A8K8P3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFI1A8K8P3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms