Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC169A6NNP5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms