Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
STRCP1A6NGW2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC29■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms