Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms