Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms