Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT87PA6NCN2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
KRT87PA6NCN2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms