Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms