Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms