Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQD8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQD8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1W2PQD8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms