Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AUP1Q9Y679 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms