Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF3C3Q9Y5Q9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.58■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms