Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F0

PCDHB13, Protocadherin beta-13, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB13Q9Y5F0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB13Q9Y5F0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB13Q9Y5F0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB13Q9Y5F0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB13Q9Y5F0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB13Q9Y5F0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB13Q9Y5F0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB13Q9Y5F0 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB13Q9Y5F0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB13Q9Y5F0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB13Q9Y5F0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB13Q9Y5F0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB13Q9Y5F0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB13Q9Y5F0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB13Q9Y5F0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB13Q9Y5F0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB13Q9Y5F0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB13Q9Y5F0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB13Q9Y5F0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB13Q9Y5F0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB13Q9Y5F0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB13Q9Y5F0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB13Q9Y5F0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB13Q9Y5F0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB13Q9Y5F0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB13Q9Y5F0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB13Q9Y5F0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms