Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAXBP1Q9Y5B6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms