Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFE2L3Q9Y4A8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms