Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF5Q9Y2D1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms