Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM35Q9UPQ4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
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