Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms