Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
ZNF608Q9ULD9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms