Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms