Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms