Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP8AP2Q9UKL3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.77■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP8AP2Q9UKL3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms