Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCTN4Q9UJW0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCTN4Q9UJW0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCTN4Q9UJW0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCTN4Q9UJW0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCTN4Q9UJW0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCTN4Q9UJW0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCTN4Q9UJW0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCTN4Q9UJW0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCTN4Q9UJW0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCTN4Q9UJW0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCTN4Q9UJW0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCTN4Q9UJW0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCTN4Q9UJW0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCTN4Q9UJW0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCTN4Q9UJW0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCTN4Q9UJW0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCTN4Q9UJW0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCTN4Q9UJW0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCTN4Q9UJW0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCTN4Q9UJW0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCTN4Q9UJW0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCTN4Q9UJW0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCTN4Q9UJW0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCTN4Q9UJW0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCTN4Q9UJW0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCTN4Q9UJW0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCTN4Q9UJW0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms