Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms