Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms