Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms