Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
MLH3Q9UHC1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms