Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms