Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL42Q9P2K6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms