Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HCN3Q9P1Z3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms