Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HMG20BQ9P0W2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms