Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD2Q9NZR1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD2Q9NZR1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD2Q9NZR1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD2Q9NZR1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD2Q9NZR1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD2Q9NZR1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD2Q9NZR1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD2Q9NZR1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD2Q9NZR1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD2Q9NZR1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD2Q9NZR1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD2Q9NZR1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD2Q9NZR1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD2Q9NZR1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms