Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms