Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY99

SNTG2, Gamma-2-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG2Q9NY99 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNTG2Q9NY99 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms