Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms