Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTG1Q9NSN8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms