Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FARSBQ9NSD9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FARSBQ9NSD9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FARSBQ9NSD9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FARSBQ9NSD9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FARSBQ9NSD9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FARSBQ9NSD9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FARSBQ9NSD9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FARSBQ9NSD9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FARSBQ9NSD9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
FARSBQ9NSD9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
FARSBQ9NSD9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
FARSBQ9NSD9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms