Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF275Q9NSD4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms