Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms