Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms