Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms