Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS4Q9NQG7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS4Q9NQG7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS4Q9NQG7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS4Q9NQG7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS4Q9NQG7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS4Q9NQG7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS4Q9NQG7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS4Q9NQG7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS4Q9NQG7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS4Q9NQG7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS4Q9NQG7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS4Q9NQG7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS4Q9NQG7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS4Q9NQG7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS4Q9NQG7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS4Q9NQG7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS4Q9NQG7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS4Q9NQG7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS4Q9NQG7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS4Q9NQG7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS4Q9NQG7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS4Q9NQG7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS4Q9NQG7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS4Q9NQG7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS4Q9NQG7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS4Q9NQG7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS4Q9NQG7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS4Q9NQG7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS4Q9NQG7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS4Q9NQG7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS4Q9NQG7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms